SREBF1核内結合因子取得 実験2

細胞:3T3-L1-TetON-FLAG-mnSrebf1 (95%分化, Day5), 10cmディッシュ10枚
薬剤処理:2ug/ml Doxycycline, 21hr→2ug/ml Doxycycline/0.2mM TBHP, 22hr
核抽出
 ・ペレット量
  ・薬剤無し:600ul
  ・Dox:400ul
  ・Dox/TBHP:400ul
 ・蛋白量/濃度
  ・薬剤無し:1.58mg, 1.65mg/ml
  ・Dox:0.91mg, 1.83mg/ml
  ・Dox/TBHP:0.71mg, 1.34mg/ml
免疫沈降
 ・ビーズ量:10ul slurry
 ・反応時間:5時間
 ・洗浄:Buffer Dで7回→Elute Bufferで3回
SDS-PAGE
 ・ローディング量:免疫沈降産物の約1/10量
 ・ゲル:5-20% gradient gel (ATTO, E-T520L)



LC-MS/MS




ヒット数
遺伝子 Accession Cont Dox Dox/TBHP
Srebf1
0 10 3
Ubp1 Q811S7 0 4 0
p300 B2RWS6 0 3 0
Cebpb P28033 0 2 0
Hdac2 A0A0R4J008 0 1 0
Hdac6 Q9Z2V5 0 1 0
Crebbp A0A0U1RQB6 0 1 0
Kdm1a A3KG93 0 1 0
Rbbp4 Q60972 0 1 0