RepeatMasker

genome上にあるRepeat配列を同定してくれるウェブサイト。サザンブロットのprobeを設計する時など、Repeat配列を避けたい時に便利。

1. RepeatMaskerへ移動。
2. 左列の一番上にあるRepeatMaskingをクリック
3. SequenceのBoxに対象となるgenome配列を入力
4. DNA sourceのドロップから、入力したgenomeの種を選択
5. Submit Sequenceをクリック
6. 暫くすると結果画面が表示されるので、一番下のResultsの中のMasked Fileをクリック
7. Repeat配列に相当する部分を、NNNNNNNNNNで隠した(Maskした)配列が出てくる