〇Gene Expression Omnibus データの登録

1. GEOに移動→Download metadata spreadsheet
2. ファイルを開く→Metadataタブ→以下の要領で入力
 ・title:論文のタイトル
 ・summary (abstract):論文のAbstract
 ・experimental design:実験内容
 ・contributor:著者
 ・library name:Sample 1など
 ・title:WAT, flox, rep1など
 ・organism:Mus musculusなど
 ・tissue:adipose tissueなど
 ・molecule:total RNAなど
 ・single or paired-end:paired-end
 ・processed data file:全てのサンプルに同じExcelのファイル名、.xlsxを付けてを入力
 ・extract protocol:RNA抽出方法
 ・library construction protocol:Library作製方法
 ・library strategy:RNA-seq
 ・genome build/assembly:mm10など
 ・processed data files format and content
  ・tab-delimited text file includes raw counts for each sample
  ・tab-delimited text file includes FPKM values for each sample
 ・PAIRED-END EXPERIMENTS:2つのファイルをセットにして入力
3. raw dataとprocessed dataを一つのフォルダ(geo_submission_RNAseq)にまとめる。
4. FileZillaをインストール→ホスト、ユーザー名、パスワードを入力→クイック接続
5. リモートサイトにpathを入力し、Enter
6. 下段の左窓から右窓にフォルダをドラッグする。
7. metadataをアップロード→Submission release dateを4年後に設定
8. 翌日にGEO accession numberがメールされる。
9. reviewer tokenを取得する。