THUNDERBIRD SYBR qPCR Mixを用いたLight Cycler

1. 標準曲線用DNAをMilliQで3-4点分希釈する(標準曲線用DNAが無い場合は、測定サンプルのいくつかを混ぜたものを用いると良い)
2. 冷蔵庫で冷やしたLightCycler Centrifuge Adapters上で、以下の試薬を混ぜる。


終濃度
THUNDERBIRD SYBR qPCR Mix (Toyobo, QPS-201)10ul
50uM Primer 10.12ul0.3uM
50uM Primer 20.12ul0.3uM
MilliQ7.76ul



Total18ul
3. LightCycler Centrifuge AdaptersにLight Cycler Capillariesをセットする
4. 操作2で調製した試薬を分注し、DNA溶液2ulを加える
5. 専用遠心機(TOMY, AR005-24)を用いて遠心800g, 4℃, 1min
6. Capillariesに蓋をセットする
7. LightCyclerを以下のように設定し、PCRをかける
 ・PCR (cDNA定量の時)
95℃
30sec

95℃
5sec

65℃
5-10sec

72℃
30sec
↑40-50 Cycle
 ・PCR(クロマチン免疫沈降の時)
95℃
30sec

95℃
20-30sec

65℃
20-30sec

72℃
30sec-1min
↑50サイクル
8. 標準曲線がほぼ直線になっている事、解離曲線がsingle peakであることを確認する。
9. 標準曲線のSlopeから増幅効率を算出し、100%に近い事を確認する(増幅効率=50*10^(-1/Slope))。